MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Pasteurella multocida subsp. multocida str. Pm70 chromosome

Total Repeats: 46127

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_002663	TC	4	8	97	104	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
2	NC_002663	A	7	7	114	120	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_002663	GA	3	6	132	137	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
4	NC_002663	GAA	2	6	146	151	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5	NC_002663	GA	3	6	179	184	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
6	NC_002663	T	6	6	212	217	0 %	100 %	0 %	0 %	15601866
7	NC_002663	CGG	2	6	282	287	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15601866
8	NC_002663	AGT	2	6	301	306	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15601866
9	NC_002663	TAA	2	6	332	337	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15601866
10	NC_002663	ACG	2	6	402	407	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15601866
11	NC_002663	TGC	2	6	464	469	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15601866
12	NC_002663	CACG	2	8	514	521	25 %	0 %	25 %	50 %	15601866
13	NC_002663	T	6	6	557	562	0 %	100 %	0 %	0 %	15601866
14	NC_002663	ACC	2	6	596	601	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15601866
15	NC_002663	CAG	2	6	631	636	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15601866
16	NC_002663	TAA	2	6	656	661	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15601866
17	NC_002663	GCA	2	6	705	710	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15601866
18	NC_002663	TTG	2	6	717	722	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15601866
19	NC_002663	TGA	2	6	732	737	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15601866
20	NC_002663	ATT	2	6	831	836	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_002663	ATT	2	6	864	869	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_002663	ATT	2	6	913	918	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_002663	ACT	2	6	982	987	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15601867
24	NC_002663	AGA	2	6	1046	1051	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15601867
25	NC_002663	ATG	2	6	1212	1217	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15601867
26	NC_002663	ATC	2	6	1334	1339	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15601867
27	NC_002663	CTT	2	6	1552	1557	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15601867
28	NC_002663	GTT	2	6	1748	1753	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15601867
29	NC_002663	CTT	2	6	1783	1788	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15601867
30	NC_002663	GAC	2	6	1834	1839	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15601867
31	NC_002663	TTC	2	6	1904	1909	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15601867
32	NC_002663	T	6	6	1931	1936	0 %	100 %	0 %	0 %	15601867
33	NC_002663	GTTT	2	8	1976	1983	0 %	75 %	25 %	0 %	15601867
34	NC_002663	GCT	2	6	2061	2066	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15601867
35	NC_002663	CCG	2	6	2074	2079	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15601867
36	NC_002663	CACTT	2	10	2174	2183	20 %	40 %	0 %	40 %	15601867
37	NC_002663	AAAT	2	8	2278	2285	75 %	25 %	0 %	0 %	15601867
38	NC_002663	GGT	2	6	2373	2378	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15601867
39	NC_002663	GCC	2	6	2424	2429	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15601867
40	NC_002663	CGC	2	6	2462	2467	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15601867
41	NC_002663	TGA	2	6	2497	2502	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15601867
42	NC_002663	ACGT	2	8	2512	2519	25 %	25 %	25 %	25 %	15601867
43	NC_002663	T	6	6	2546	2551	0 %	100 %	0 %	0 %	15601867
44	NC_002663	ATA	2	6	2610	2615	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15601867
45	NC_002663	CAAT	2	8	2686	2693	50 %	25 %	0 %	25 %	15601867
46	NC_002663	T	6	6	2711	2716	0 %	100 %	0 %	0 %	15601867
47	NC_002663	GCA	3	9	2742	2750	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15601867
48	NC_002663	ATA	2	6	2754	2759	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15601867
49	NC_002663	TCA	2	6	2775	2780	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15601867
50	NC_002663	CCA	2	6	2865	2870	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15601867
51	NC_002663	AAT	2	6	2891	2896	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15601867
52	NC_002663	T	6	6	2960	2965	0 %	100 %	0 %	0 %	15601867
53	NC_002663	CCTAAA	2	12	3021	3032	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	15601867
54	NC_002663	CCG	2	6	3034	3039	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15601867
55	NC_002663	AGC	2	6	3233	3238	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15601867
56	NC_002663	TAAA	2	8	3279	3286	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_002663	TAAA	2	8	3310	3317	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_002663	A	6	6	3326	3331	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_002663	T	7	7	3362	3368	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_002663	T	6	6	3383	3388	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_002663	AAT	2	6	3389	3394	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_002663	TAG	2	6	3416	3421	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
63	NC_002663	AATG	2	8	3434	3441	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
64	NC_002663	AGTC	2	8	3580	3587	25 %	25 %	25 %	25 %	15601868
65	NC_002663	TTA	2	6	3788	3793	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15601868
66	NC_002663	TGA	2	6	3796	3801	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15601868
67	NC_002663	CAA	2	6	3893	3898	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15601868
68	NC_002663	GTG	2	6	3924	3929	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15601868
69	NC_002663	TGA	2	6	3967	3972	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15601868
70	NC_002663	ATC	2	6	4008	4013	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15601868
71	NC_002663	GCG	2	6	4031	4036	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15601868
72	NC_002663	AGT	2	6	4048	4053	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15601868
73	NC_002663	GAT	2	6	4091	4096	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15601868
74	NC_002663	GAA	2	6	4133	4138	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15601868
75	NC_002663	TAA	2	6	4150	4155	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15601868
76	NC_002663	CAGT	2	8	4192	4199	25 %	25 %	25 %	25 %	15601869
77	NC_002663	AC	3	6	4319	4324	50 %	0 %	0 %	50 %	15601869
78	NC_002663	ATT	2	6	4404	4409	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15601869
79	NC_002663	TGC	2	6	4436	4441	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15601869
80	NC_002663	TGT	2	6	4520	4525	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15601869
81	NC_002663	ATTT	2	8	4549	4556	25 %	75 %	0 %	0 %	15601869
82	NC_002663	CAC	2	6	4612	4617	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15601869
83	NC_002663	TAT	2	6	4628	4633	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15601869
84	NC_002663	TGG	2	6	4634	4639	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15601869
85	NC_002663	T	6	6	4719	4724	0 %	100 %	0 %	0 %	15601869
86	NC_002663	ATT	2	6	4776	4781	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15601869
87	NC_002663	CAA	2	6	4806	4811	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15601869
88	NC_002663	AAG	2	6	4813	4818	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15601869
89	NC_002663	TCC	2	6	4836	4841	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	15601869
90	NC_002663	TTTGGT	2	12	4845	4856	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15601869
91	NC_002663	TTA	2	6	4870	4875	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15601869
92	NC_002663	TA	3	6	4891	4896	50 %	50 %	0 %	0 %	15601869
93	NC_002663	TTC	2	6	4935	4940	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15601869
94	NC_002663	T	6	6	4973	4978	0 %	100 %	0 %	0 %	15601869
95	NC_002663	GCG	2	6	5049	5054	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15601869
96	NC_002663	GTTGT	2	10	5105	5114	0 %	60 %	40 %	0 %	15601869
97	NC_002663	TGG	2	6	5209	5214	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15601869
98	NC_002663	CCTC	2	8	5236	5243	0 %	25 %	0 %	75 %	15601869
99	NC_002663	GCA	2	6	5280	5285	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15601869
100	NC_002663	TTA	2	6	5333	5338	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15601869
101	NC_002663	TCGC	2	8	5351	5358	0 %	25 %	25 %	50 %	15601869
102	NC_002663	ATTTA	2	10	5387	5396	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_002663	T	6	6	5417	5422	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_002663	ATG	2	6	5564	5569	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15601870
105	NC_002663	GCTT	2	8	5599	5606	0 %	50 %	25 %	25 %	15601870
106	NC_002663	GCG	2	6	5658	5663	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15601870
107	NC_002663	TTGGC	2	10	5724	5733	0 %	40 %	40 %	20 %	15601870
108	NC_002663	CAA	2	6	5735	5740	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15601870
109	NC_002663	AACGC	2	10	5779	5788	40 %	0 %	20 %	40 %	15601870
110	NC_002663	TGT	2	6	5808	5813	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15601870
111	NC_002663	TCA	2	6	5821	5826	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15601870
112	NC_002663	CAA	2	6	5876	5881	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15601870
113	NC_002663	CCG	2	6	5976	5981	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15601870
114	NC_002663	CAC	2	6	6088	6093	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15601870
115	NC_002663	G	6	6	6119	6124	0 %	0 %	100 %	0 %	15601870
116	NC_002663	CCA	2	6	6142	6147	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15601870
117	NC_002663	ATT	2	6	6163	6168	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15601870
118	NC_002663	A	6	6	6170	6175	100 %	0 %	0 %	0 %	15601870
119	NC_002663	AGC	2	6	6223	6228	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
120	NC_002663	AG	3	6	6260	6265	50 %	0 %	50 %	0 %	15601871
121	NC_002663	AAGC	2	8	6284	6291	50 %	0 %	25 %	25 %	15601871
122	NC_002663	ATT	2	6	6409	6414	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15601871
123	NC_002663	GTT	2	6	6421	6426	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15601871
124	NC_002663	TTG	2	6	6456	6461	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15601871
125	NC_002663	TAT	2	6	6564	6569	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15601871
126	NC_002663	GCG	2	6	6578	6583	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15601871
127	NC_002663	CTTT	2	8	6590	6597	0 %	75 %	0 %	25 %	15601871
128	NC_002663	TGG	2	6	6611	6616	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15601871
129	NC_002663	ATT	2	6	6631	6636	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15601871
130	NC_002663	GGC	2	6	6704	6709	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15601871
131	NC_002663	TTA	2	6	6713	6718	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15601871
132	NC_002663	TTA	2	6	6722	6727	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15601871
133	NC_002663	TTAT	2	8	6737	6744	25 %	75 %	0 %	0 %	15601871
134	NC_002663	T	6	6	6756	6761	0 %	100 %	0 %	0 %	15601871
135	NC_002663	AAGG	2	8	6902	6909	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
136	NC_002663	TTA	2	6	7007	7012	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15601872
137	NC_002663	CGT	2	6	7021	7026	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15601872
138	NC_002663	CAG	2	6	7047	7052	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15601872
139	NC_002663	CAA	2	6	7058	7063	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15601872
140	NC_002663	ATGT	2	8	7082	7089	25 %	50 %	25 %	0 %	15601872
141	NC_002663	GT	3	6	7119	7124	0 %	50 %	50 %	0 %	15601872
142	NC_002663	T	6	6	7225	7230	0 %	100 %	0 %	0 %	15601872
143	NC_002663	TG	3	6	7249	7254	0 %	50 %	50 %	0 %	15601872
144	NC_002663	TGG	2	6	7277	7282	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15601872
145	NC_002663	ATTTT	2	10	7313	7322	20 %	80 %	0 %	0 %	15601872
146	NC_002663	AGC	2	6	7384	7389	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15601872
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149	NC_002663	GAGC	2	8	7470	7477	25 %	0 %	50 %	25 %	15601872
150	NC_002663	ATG	2	6	7550	7555	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15601872
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154	NC_002663	T	6	6	7675	7680	0 %	100 %	0 %	0 %	15601873
155	NC_002663	T	6	6	7695	7700	0 %	100 %	0 %	0 %	15601873
156	NC_002663	TG	3	6	7725	7730	0 %	50 %	50 %	0 %	15601873
157	NC_002663	TTG	2	6	7760	7765	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15601873
158	NC_002663	GA	3	6	7789	7794	50 %	0 %	50 %	0 %	15601873
159	NC_002663	ATTT	2	8	7975	7982	25 %	75 %	0 %	0 %	15601874
160	NC_002663	GTG	2	6	7998	8003	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15601874
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162	NC_002663	ATG	2	6	8263	8268	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15601874
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164	NC_002663	AGCG	2	8	8349	8356	25 %	0 %	50 %	25 %	15601874
165	NC_002663	AAG	2	6	8395	8400	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15601874
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174	NC_002663	TAT	2	6	8826	8831	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15601875
175	NC_002663	TTA	2	6	8897	8902	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15601875
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177	NC_002663	GCCTTT	2	12	8966	8977	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	15601875
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179	NC_002663	TAT	2	6	9098	9103	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15601875
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181	NC_002663	TTG	2	6	9182	9187	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15601875
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183	NC_002663	TTA	2	6	9239	9244	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15601875
184	NC_002663	TGCT	2	8	9266	9273	0 %	50 %	25 %	25 %	15601875
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201	NC_002663	CA	3	6	9829	9834	50 %	0 %	0 %	50 %	15601875
202	NC_002663	TG	3	6	9919	9924	0 %	50 %	50 %	0 %	15601875
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233	NC_002663	TGA	2	6	11479	11484	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15601878
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241	NC_002663	AAC	2	6	11793	11798	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15601878
242	NC_002663	ATC	2	6	11799	11804	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15601878
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250	NC_002663	GAT	2	6	12163	12168	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15601878
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252	NC_002663	ATTC	2	8	12221	12228	25 %	50 %	0 %	25 %	15601878
253	NC_002663	AAG	2	6	12243	12248	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15601878
254	NC_002663	AAG	2	6	12252	12257	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15601878
255	NC_002663	AGTG	2	8	12326	12333	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
256	NC_002663	CTT	2	6	12335	12340	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
257	NC_002663	TATT	2	8	12362	12369	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
258	NC_002663	TCA	2	6	12448	12453	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15601879
259	NC_002663	ATT	2	6	12474	12479	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15601879
260	NC_002663	ATT	2	6	12521	12526	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15601879
261	NC_002663	TTTTC	2	10	12602	12611	0 %	80 %	0 %	20 %	15601879
262	NC_002663	AAC	2	6	12678	12683	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15601879
263	NC_002663	TGA	2	6	12784	12789	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15601879
264	NC_002663	TTA	2	6	12850	12855	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15601880
265	NC_002663	TTA	2	6	12862	12867	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15601880
266	NC_002663	AG	3	6	12951	12956	50 %	0 %	50 %	0 %	15601880
267	NC_002663	AC	3	6	12960	12965	50 %	0 %	0 %	50 %	15601880
268	NC_002663	A	6	6	13293	13298	100 %	0 %	0 %	0 %	15601880
269	NC_002663	T	6	6	13316	13321	0 %	100 %	0 %	0 %	15601880
270	NC_002663	A	6	6	13345	13350	100 %	0 %	0 %	0 %	15601880
271	NC_002663	GAA	2	6	13360	13365	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15601880
272	NC_002663	TTA	2	6	13460	13465	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
273	NC_002663	A	6	6	13479	13484	100 %	0 %	0 %	0 %	15601881
274	NC_002663	TTA	3	9	13491	13499	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15601881
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404	NC_002663	CT	3	6	19504	19509	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
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